У негрито денисовская примесь больше, чем у папуасов.
Жінки-мисливиці аета в засідці чекають дичину, яку женуть загонщики. Провінція Кагаян (посів. Лусон. Фото П. Б. Гріффіна. 1982.
Генетики продовжують прояснювати деталі денисівської Санта-Барбари. Хоча число знахідок денісівських кісток, як і раніше, невелике, їх генетичний слід простягнувся з Алтаю в Південно-Східну Азію, на острови Океанії, в Австралію і навіть у Новий Світ; з'ясувалося, що в контакт із сучасними людьми вступали різні «денисовоподібні» популяції, що відрізнялися один від одного і від еталонних алтайських денисівців.
Вважалося, що володарі найбільшої денисівської домішки - жителі Папуа - Нової Гвінеї (в середньому 2,9%). Тепер пальму першості перехоплюють аета Філіппін. Ці племена - їх відносять до негріто - живуть на Лусоні та деяких інших островах Філіппін. Вони невисокого зросту, темношкірі, відносяться до австрало-меланезійської раси і вважаються нащадками найдавніших сапієнсів, які заселили Сунду близько 50 тис. років тому (Сунда - це півострів Малакка і острови, які в останній льодовиковий період були частиною Азії), а потім мігрували на Філіппіни. Зрозуміло, на цю першу хвилю мігрантів наклалися більш пізні потоки переселенців з материка, які зробили свій внесок у генофонд аета.
Автори нової статті, опублікованої в Current Biology, проаналізували геноми 1107 осіб зі 118 різних етнічних груп Філіппін, включаючи 25 популяцій негрито.
До речі, цікаво, що в цій науковій публікації спокійно використовується назва «негріто» (Negrito), хоча це слово - зменшувальне від Negro, тобто родинно жахливому слову на букву Н і було введено у вживання іспанськими місіонерами.
Дослідження показало, що негритоси споріднені папуасам, але в їх генофонді є значна примісь жителів Східної Азії - мабуть, щодо недавніх мігрантів з Південного Китаю (інтрогресія сталася приблизно 2300 років тому). Втім, у різних племен відсоток східноазіатських генів розрізняється, найменше - 10 - 30% - у аета магбукон і амбалу з Центрального Лусона.
Потім дослідники почали оцінювати внесок у генофонд негрито архаїчних гомінін. Виявилося, що неандертальська примісь у аборигенів Філіппін така ж, як у всіх неафриканців, а ось денисівська вище, ніж у австралійців і папуасів. Особливо великий відсоток денісівської ДНК у аета магбукон - в середньому на 24% більше, ніж у папуасів (52 мегабази порівняно з 42).
І це незважаючи на наявність у аета домішки східних азіатів, яка повинна була розбавити архаїчну ДНК. Якщо ж робити на це поправку, у «несмішаних» предків сучасних аета денісівська частка повинна бути на 46% вище, ніж у папуасів.
Щоб перевірити отриманий результат, дослідники секвенували з високою якістю (покриття 37х) геноми п'яти представників магбукон. Їх аналіз підтвердив, що аета володіють найвищою денисівською домішкою в світі. Крім того, денісовські послідовності в ДНК магбукон лише помірно схожі на еталонний геном денисовця з Алтаю (збіг близько 50%) - як і у жителів Папуа. Це означає, що негрито Лусона, як і папуаси, змішувалися з якимись місцевими популяціями гомінін, лише віддалено спорідненими денисівцям.
З чим пов'язаний високий рівень архаїчної домішки у аета? Можливо, змішання відбувалося недавно? Однак у цьому випадку денисівські фрагменти в ДНК аета були б довшими, ніж у папуасів. В реальності це не так, судячи з довжини архаїчних послідовностей, папуаси і негрито зустрічалися з денисівцями приблизно в один і той же час. Значить, більший розмір денисівської ДНК у аета говорить про те, що мало місце кілька різних змішань. Моделювання, проведене дослідниками, підтвердило, що після поділу ліній предків папуасів і негрито і ті, і інші окремо змішувалися з різними популяціями денисівців десь на просторах островів Південно-Східної Азії і Океанії.
Де ж тоді на цих островах останки денисівців? Дослідники нарікають на те, що досі про те, як могли виглядати ці стародавні люди, відомо дуже мало. Автори публікації не можуть не згадати нещодавно описаний вид Homo luzonensis - дивних пігмеїв з острова Лусон, відомих за знахідками в печері Калао віком 67 тис. років. Чи не острівні це денисівці? Правда, характерна денисівська риса - величезні зубищі. У лузоненсисів зуби крихітні, моляри менше навіть, ніж у хоббітів з Флореса. Але що не створить еволюція на острові за сотні тисяч років! Автори навіть допускають, що і флореські хоббіти теж могли бути денисівською ріднею, що здається зовсім фантастикою. Втім, для перевірки таких гіпотез потрібен геном (малоймовірно) або хоча б протеом хоббітів Флореса і Лусона.
У зв'язку з цим вкрай цікаво інше дослідження, результати якого опубліковані в Nature - аналіз геному стародавньої людини з Сулавесі. Скелет, прозваний Бессе, знайшли 2015 року під час розкопок у містечку Леанг Паннінге на півдні Сулавесі. Вік поховання - 7200 - 7300 років, його відносять до тоалі - культури мисливців-збирачів, нащадків перших мігрантів, які прибули на Сулавесі понад 40 тис. років тому. Судячи з усього, скелет належав дівчині 17 - 18 років. Дуже здорово, що з кісток вдалося витягти ДНК, тому що стародавніх геномів з цього регіону відомо дуже небагато - їх всього два, Пха Фаєн з Лаосу (близько 8 тис. років) і Гуа Ча з Малайзії (4,3 тис. років). Тропічний клімат не сприяє збереженню нуклеотидних ланцюжків. Поховання людини в Леанг Паннінгу. Скупчення фрагментів черепа.
Дослідники отримали частину ядерної і майже всю мітохондріальну ДНК з скроневої кістки Бессе. Підтвердили жіночий пол. Що стосується родоводу Бессе, дівчина виявилася проміжною між австралійцями, онге - корінними жителями Андаманських островів, і стародавніми жителями Азії. Лінія Бессе відокремилася приблизно в той же час, коли розділилися предки папуасів і жителів Австралії. Серед сучасних людей прямих нащадків жінки з Леанг Паннінге знайти не вдалося, нинішні остров'яни їй не рідня.
А ще у неї виявилася висока денисівська примісь, 2,2% - це трохи менше, ніж у папуасів (у них 2,9%), але набагато вище, ніж у сучасних сулавесців і жителів Зондських островів, у голоценових Пха Фаєн і Гуа Ча і у набагато більш стародавнього китайця з печери Тяньюань (40 тис. років).
Все це означає, що предки Бессе та інших людей, які заселяли острови Південно-Східної Азії, рухалися різними маршрутами, а змішання з денисівцями могло відбуватися близько до Сулавесі або навіть прямо на острові - адже тут явно жив хтось архаїчний, що підтверджується знахідками гармат віком понад 100 тис. років на південному заході острова.
Чому ж частка денисівської ДНК у Бессе менша, ніж у папуасів? Мабуть, в результаті більш пізнього змішання з кимось, у кого в роду денисівців не було.
Терпеливо чекаємо геномів/протеомів з кісток інших стародавніх людей Індонезії, Філіппін, Австралії...